2007 yılında Genelkurmay Başkanlığı’nın internet sitesinde yayımlanan açıklamada, laiklik konusunda yaşanan gelişmelere ilişkin ordunun tutumuna vurgu yapılmıştı. Kamuoyunda kısa sürede “e-muhtıra” olarak nitelendirilen bildiri, dönemin siyasi atmosferinde ciddi tartışmalara neden olmuştu.
Yaşar Büyükanıt ise ilerleyen dönemde yaptığı açıklamalarda söz konusu metnin bir muhtıra olmadığını, yalnızca kamuoyunu bilgilendirmeye yönelik bir açıklama niteliği taşıdığını savunmuştu